Método de análisis de expresión diferencial: DESeq
Datos generales
Duración: 2 horas
Nivel: Intermedio
Idioma: Español
Fecha: 27 de marzo de 2025
Duración: 2 horas
Nivel: Intermedio
Idioma: Español
Fecha: 27 de marzo de 2025
Horario: 17:00 a 19:00 (centro de México)
Modalidad: En línea
Descripción
En este taller exploraremos el análisis de expresión diferencial de genes a partir de datos de secuenciación masiva de RNA-Seq, utilizando DESeq, una de las herramientas más utilizadas en R para este propósito.
Pre-requisitos:
Computadora con al menos 8 GB de memoria RAM, aplicación Zoom, computadora con permisos de administrador para poder instalar:
R v3.9 o superior
RStudio
Bioconductor: https://www.bioconductor.org/install/
Para quién va dirigido este mini curso:
Este taller está dirigido a investigadores, docentes y estudiantes interesados en el análisis de transcriptomas mediante RNA-Seq. Se recomienda tener conocimientos básicos de R para aprovechar al máximo la sesión. Detalles del evento:
- El evento será gratuito y exclusivo para miembros de la RMB.
- Las instrucciones de acceso serán enviadas por parte de la RMB a sus miembros activos un día previo al evento.
Actividades:
- 16:45 am a 17:00 pm: Conéctate a Zoom y configura tu micrófono
- 17:00 pm a 17:05 pm: Introducción de parte de la Red Mexicana de Bioinformática
- 17:05 pm a 17:15 pm: Código de conducta y cómo usar la plataforma de Zoom
- 17:15 pm a 19:00 pm: Actividad del curso
Organizadores:
Red Mexicana de Bioinformática (RMB)
Formulario de registro:
Nombre de los ayudantes:
Leticia Vega Alvarado
Elizabeth Ernestina Godoy Lozano
Anahí Canedo Téxon
Reseña de los instructores
M. en C. Verónica Jimenez Jacinto
Realiza análisis Bioinformáticas de RNASeq, Ensamblados de Novo y Análisis de Expresión diferencial en la Unidad Universitaria de Secuenciación Masiva de ADN y Bioinformática con sede en el instituto de biotecnología de la UNAM.
Es responsable del sistema de Gestión de Calidad del Laboratorio Nacional de Apoyo Tecnológico a las ciencias Genómicas.
Tiene la certificación como instructor de instructores de Software Carpentries.
Es cofundadora de RLadies Cuernavaca.
