Introducción a R, RStudio y Bioconductor para expandir tu horizonte bioinformático
Datos generales
Código: T1- Intro-R
Duración: 2 horas
Nivel: Básico- intermedio
Idioma: español
Fecha: 6 de julio de 2020
Duración: 2 horas
Nivel: Básico- intermedio
Idioma: español
Fecha: 6 de julio de 2020
Horario: 12:00 a 14:00 (centro de México)
Modalidad: Online
Descripción
Este mini-curso es a una sesión introductoria sobre R para bioinformática. Aprenderás qué es lenguaje de programación de R, qué es el proyecto de Bioconductor, cómo descargar datos públicos y formas de explorarlos. Para esto se utilizará la plataforma de RStudio y tú podrás hacer lo mismo en tu computadora. Esta sesión te servirá de introducción al amplio mundo de R y de Bioconductor en el cual existen muchas herramientas útiles para analizar datos bioinformáticos. Estas herramientas se usan en muchas empresas y laboratorios de investigación. El evento incluirá un espacio donde podrás interaccionar con participantes de la RMB.
Pre-requisitos:
- Computadora con permisos de administrador para poder instalar R, RStudio y Bioconductor.
- Recomendamos usar una computadora con al menos 8 GB de memoria RAM.
- Tener instalada la aplicación Zoom (https://zoom.us/download)
Para quién va dirigido este mini curso:
Personas interesadas en conocer brevemente el lenguaje R, la plataforma RStudio y el proyecto Bioconductor.
Detalles del evento:
- El evento será gratuito y exclusivo para miembros de la RMB y para personas que hayan enviado su registro de participación al Encuentro de Bioinformática en México 2020 http://www.nnb.unam.mx/TIB2020/.
- El día del evento, a las 9:00 am, se enviarán por correo electrónico las instrucciones de cómo conectarse a la sesión de Zoom.
Actividades:
- 11:45 am a 12:00 pm: Conéctate a Zoom y configura tu micrófono
- 12:00 pm a 12:05 pm: Introducción de parte de la Red Mexicana de Bioinformática
- 12:05 pm a 12:15 pm: Código de conducta y cómo usar la plataforma de Zoom
- 12:15 pm a 1:30 pm: Actividad del curso
- 1:30 a 2:00 pm: Conéctacte con participantes de la RMB
Organizadores:
Red Mexicana de Bioinformática (RMB), Nodo Nacional de Bioinformática del Centro de Ciencias Genómicas (CCG-UNAM) y la Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB).
Reseña de los instructores
Joselyn es estudiante de doctorado en el Instituto de Biotecnología de
la UNAM, miembro de la RMB, de la CDSB y co-fundadora de R-Ladies
Cuernavaca. Su proyecto de doctorado está enfocado en el estudio de la
regulación transcripcional en prokariotas, donde utiliza R para diversos
análisis. Adicionalmente, está interesada en el desarrollo de software y
participó en la generación del paquete regutools disponible en Bioconductor.
Alejandra Medina-Rivera
Alejandra Medina-Rivera
Alejandra obtuvo su doctorado en la Universidad Nacional Autónoma de
México, desde entonces se ha enfocado en el desarrollo de herramientas
bioinformáticas para análisis de datos genéticos. Actualmente, es
investigadora en el Laboratorio Internacional de Investigación sobre el
Genoma Humano en la UNAM, donde se enfoca en identificar variantes
genéticas que ocasionan fallas en la regulación de la expresión de
genes. Desde 2019 es presidenta de la Red Mexicana de Bioinformática.
Leonardo Collado-Torres
Leonardo usa R diario y ha contribuido paquetes al proyecto de Bioconductor como parte de su trabajo en LIBD.
El está interesado en tecnologías genómicas que generan datos a gran
escala como RNA-seq, avances en R y en ayudar a otros a empezar su
aventura con R. Leonardo ha estado aprendiendo y enseñando R desde el
2008 y es co-fundador del LIBD rstats club. Desde el 2020 es miembro del Bioconductor Community Advisory Board.
Joselyn, Alejandra y Leonardo son miembros de la Junta Directiva de la Comunidad de Desarrolladores de Software en Bioinformática (CDSB) https://comunidadbioinfo.github.io/, https://twitter.com/CDSBMexico.
La CDSB es un nodo de la Red Mexicana de Bioinformática https://redmexicanadebioinformatica.org/, https://twitter.com/RBioinformatica.
This event was funded in full by a grant from Code for Science & Society, made possible by grant number GBMF8449 from the Gordon and Betty Moore Foundation
(https://doi.org/10.37807/GBMF8449)
(https://doi.org/10.37807/GBMF8449)
